質問「いつも楽しくブログを拝見しています。カスタマイズについて質問があります。お客様の要望は大抵聞いてもらえると伺いましたが、何か制限とかありますか？」
答え「お店（パートナー）によって多少の制限があります。」
この答えが一番しっくりくると思います。例えばホットのドリンクにフラペチーノに入れるチョコチップを入れて欲しいと頼まれた場合、ぼくは「チョコの風味をプラスするならチョコソースのほうがいいですよ」と言っていました。もちろんそれでも入れてくれと言われれば入れます。また、期間限定のドリンクのシロップが残っていた場合、それを他のドリンクに追加することも可能ですが、在庫がないお店もあります。また、レジキーにないものはカスタムできません（これは時々かわるので明確にはお答えできません）
参考になりましたでしょうか？
カスタマイズも楽しみの1つですよね。他の質問にはまた後日お答えします。