別名「蚕ノ社」と呼ばれる「木嶋坐天照御魂（このしまにますあまてるみたま）神社」。その名の由来は、境内に蚕をまつる「養蚕神社」があるためと言われている。本殿西に建てられているのは京都三珍鳥居の一つ、三柱鳥居。三つの鳥居を正三角形に組み合わせた形が特徴だ。現在は柵などで囲われているため近づくことはできないが、以前は三方向から拝めるようになっていたという。

木嶋神社（木嶋坐天照御魂神社）は創建年月は不詳であるが「続日本記」大宝元年（701年：飛鳥・古墳時代）4月3日の条に、神社名が記載されていることから、それ以前に祭祀されたと思われる古社。天之御中主神を主神として奉り、広隆寺創建とともに勧請されたものと伝えられる。学問の神であり、祓いの神でもある。延喜式内社で祭神は天之御中主神外四柱を祀っている。

蚕ノ社（養蚕神社）

本殿の東側に養蚕神社（こかいじんじゃ）があり、蚕ノ社（かいこのやしろ）とも呼ばれている。雄略天皇の時代（約1500年前）に、大陸より渡来した秦酒公（はたのさけきみ）が優れた絹織工を率いて、数多くの絹、綾を織り出し禹豆麻佐（うずまさ）の姓をいただいた。その後、この地域一帯が太秦と呼ばれる。推古天皇の時代となり、その報恩と繁栄を祈るため、養蚕、織物、染織の祖神を祀っており、その守護神とされる。

元糺の森

境内周辺の巨樹が生い茂る原生林は元糺の森（もとただすのもり）と呼ばれている